分辨率最高可达140,000 FWHM；全扫描和全离子裂解（AIF）模式下，质量准确度优于 1 ppm；扫描速度为12 Hz；质量范围最高至至 6,000m/z

药物代谢平台是药学技术中心最早建立的平台，配置有多种色谱质谱联用仪，包括三重四极杆液质联用仪、高分辨液相色谱质谱联用仪、制备液相色谱和离子色谱等，平台由一名主管和三名技术工程师组成，平台以科研需求为出发点，以创新技术为核心，采用分析新方法新技术解决药学科研中的瓶颈问题，提供基于化学药物、中药、生物药、代谢组学、药代动力学的LC-MS分析应用

药物代谢平台建立了基于液质联用技术的中药复杂体系化学成分快速分析策略，平台采用QE Plus高分辨质谱采集了1200余种中药化合物对照品的一级和碎片质谱图采集，获得了7000余张目前行业内最高质量的二级质谱图，建立中药化学成分数据库。通过液质联用技术实现中药复杂体系中天然产物成分的有效分离和快速的表征，提供化合物的留时间、质荷比、同位素分布和碎片离子信息，并给出对应化合物的准确定性结果。采用基于相对质谱丰度的全化合物成分配匹配方法，该策略可以获得复杂中药体系药材组分谱，并基于mzcloud质谱数据库进行中成药、中药制剂、保健品等的西药添加和掺假分析。中药复杂体系化合物分析策略目前已支撑了清华大学及其他单位的多项中药现代化研究工作，鉴定了金银花、重楼、紫苏、茯苓等多种药材以及益气解毒、养血清脑、六味地黄等200余种中药材及中药复方的化学成分。该数据库目前已成功转化为Compound discover质谱数据处理软件的标准配置，在平台上进行开放共享，在行业内有较高的影响力，支持中药研究内领域科研和产品研发工作。